Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms