Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LAMA3Q16787 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMA3Q16787 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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