Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CLPPQ16740 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLPPQ16740 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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