Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FSCN1Q16658 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms