Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF239Q16600 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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