Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCSK7Q16549 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms