Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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NEDD8Q15843 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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NEDD8Q15843 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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NEDD8Q15843 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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NEDD8Q15843 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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NEDD8Q15843 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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NEDD8Q15843 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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