Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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VAMP3Q15836 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VAMP3Q15836 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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