Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHRNA6Q15825 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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