Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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