Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3GAP1Q15042 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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RAB3GAP1Q15042 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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RAB3GAP1Q15042 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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RAB3GAP1Q15042 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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RAB3GAP1Q15042 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RAB3GAP1Q15042 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RAB3GAP1Q15042 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RAB3GAP1Q15042 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3GAP1Q15042 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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