Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNIP1Q15025 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms