Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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