Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCLAFQ15004 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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