Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRT33BQ14525 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms