Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ERV3-1Q14264 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ERV3-1Q14264 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ERV3-1Q14264 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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ERV3-1Q14264 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ERV3-1Q14264 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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