Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM53BQ14153 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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