Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTCH1Q13635 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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