Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEUROD1Q13562 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD1Q13562 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
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