Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB3Q13509 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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