Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD4Q13485 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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