Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms