Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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TRAF1Q13077 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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TRAF1Q13077 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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TRAF1Q13077 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAF1Q13077 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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