Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MKRN3Q13064 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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