Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms