Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TROQ12816 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TROQ12816 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TROQ12816 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TROQ12816 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TROQ12816 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
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