Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SCAPQ12770 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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