Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPAL4Q0D2K0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPAL4Q0D2K0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms