Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FMODQ06828 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FMODQ06828 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms