Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PAX8Q06710 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms