Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
REG3AQ06141 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms