Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms