Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNB3Q05901 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms