Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GBE1Q04446 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms