Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms