Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF8Q02556 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms