Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4GALNT1Q00973 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms