Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNB1P98172 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms