Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VLDLRP98155 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms