Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP5P82980 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP5P82980 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP5P82980 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RBP5P82980 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBP5P82980 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBP5P82980 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBP5P82980 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP5P82980 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP5P82980 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RBP5P82980 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms