Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRX6P78412 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRX6P78412 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRX6P78412 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRX6P78412 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX6P78412 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX6P78412 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX6P78412 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX6P78412 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX6P78412 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRX6P78412 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms