Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P63132 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms