Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCBP4P57723 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms