Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PLTPP55058 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLTPP55058 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLTPP55058 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLTPP55058 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLTPP55058 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLTPP55058 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLTPP55058 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLTPP55058 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLTPP55058 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLTPP55058 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLTPP55058 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLTPP55058 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLTPP55058 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLTPP55058 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLTPP55058 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLTPP55058 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms