Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRISP1P54107 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms