Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DAP3P51398 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DAP3P51398 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms