Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TUFMP49411 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TUFMP49411 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TUFMP49411 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUFMP49411 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUFMP49411 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUFMP49411 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUFMP49411 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUFMP49411 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUFMP49411 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUFMP49411 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUFMP49411 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms