Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK8P49336 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK8P49336 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK8P49336 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms