Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TGM4P49221 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TGM4P49221 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms