Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLD2P49005 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLD2P49005 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD2P49005 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms